沼泽土：在保护区内分布较广，不受垂直影响，在河流源头，山地、沟谷、湖滨平原低洼处都有分布。沼泽土养分丰富，植被生长茂盛，多生长喜湿植物，蒿草、海韭菜、毛莨以及苔藓和地衣等生长良好。
风沙土：集中分布于湖东沙地以及湖滨滩地，甘子河中、下游，吉尔孟河下游地区。流动风沙土地表干燥，土地松散，植物定居困难，在低洼潮湿处在早熟禾、西伯利亚蓼及蓼科植物生长。固定风沙土形成波状起伏，植被略多，主要有芨草、针茅、冰草、羊茅等。
盐土：盐土呈块状或带状分布，主要分布在青海湖北岸，含盐量高，植物生长稀疏，成片状分布。盐土植物主要有早熟禾，其次为西伯利亚蓼及蓼科植物。
栗钙土：分布于布哈河中游的山前冲积阶地，湖滨平原以及丘陵地的前沿地带。栗钙土植被属草原植被类型，由旱生多年生植被草类组成，以丛生禾草为主。湖滨平原以芨芨草、针茅、细叶苔草、冰草、早熟禾、赖草为主。栗钙土分布的地区，已有部分开垦成农田。
